Молекул биотехнологийн үндсэн арга зүйг тусгасан: рекомбинант ДНХ бүтээн ерөнхий арга зүй, прокариот болон эукариот дахь генийн экспрессийн манипуляц, чиглэсэн мутагенез, онош зүйн молекул үндэс, вакцины молекул үндэс, рекомбинант эсрэг биет бүтээх, эмийн бодисыг микробиологийн аргаар нийлэгжүүлэх, хортой нэгдлийг задлах, трансген ургамал, амьтан, ген эмчилгээ болон анагах ухаан, хүрээлэн буй орчинд молекул биотехнологийн хэрэглээ.